在自然条件下,最好选择晴天收获,操作方便,天麻不带泥水,品质好,耐贮藏。收获天麻都采用人工刨挖的方法,先用挖锄去表层土壤,剑麻顶端都向上生长,往往长在菌材上边,铲土时最容易铲掉顶芽,故应小心铲挖,将近菌材时即用洋镐撬起菌棒拣出天麻。有时两根菌棒间天麻紧紧挤压在一起,撬棒时容易弄断天麻,故应特别小心。菌棒完全挖出后,应检查窝壁四周土壤中生长的天麻,尤其是靠上坡方容易长天麻,防止漏收。
在产区为了防止挖烂,麻农带上手套用手刨,防止手损伤。